近日，中國工程院院士、廣東省科學(xué)院微生物研究所名譽所長吳清平團隊完成了白肉靈芝的全基因組測序。據(jù)悉，這是世界上首次對白肉靈芝的基因組進行組裝和注釋。相關(guān)研究發(fā)表于《G3：基因，基因組，遺傳學(xué)》。
白肉靈芝是在中國發(fā)現(xiàn)的靈芝科一新種，具有多種藥理活性。作為我國具有鮮明地域特色的野生資源，白肉靈芝目前已成為科技扶貧和帶動一方經(jīng)濟發(fā)展的重要資源，在中國西南地區(qū)廣泛種植。但由于缺乏參考基因組，其遺傳研究受到了阻礙。
研究人員從一個單核菌株中提取了高質(zhì)量的DNA，并基于Illumina和Nanopore平臺組裝完成第一個白肉靈芝全基因組。組裝的基因組大小為50.05Mb，N50為3.06Mb，預(yù)測到78206條編碼序列和13390個基因。
此外，研究人員分析了白肉靈芝和靈芝之間次級代謝產(chǎn)物(萜類化合物)的功能基因的差異。研究發(fā)現(xiàn)，與靈芝相比，白肉靈芝具有更多與萜類化合物合成相關(guān)的基因，這可能是它們表現(xiàn)出不同生物活性的原因之一。
據(jù)吳清平團隊成員胡惠萍介紹，白肉靈芝基因組是目前組裝質(zhì)量最好的靈芝屬物種。該成果為今后特定物種的高原適應(yīng)性深層研究奠定了基礎(chǔ)。(記者 朱漢斌 通訊員 李誠斌)
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