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利用代謝組和轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析 構(gòu)建水稻全生育期代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

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日期:2021-11-09 13:55:45    來源:《中國科學(xué)報》    

近日,海南大學(xué)熱帶作物學(xué)院教授羅杰團(tuán)隊在《分子植物》在線發(fā)表了題為《水稻全生育期代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò)》的研究論文。

該研究利用代謝組和轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析,構(gòu)建了水稻全生育期主要組織器官的代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò),并精準(zhǔn)識別了調(diào)節(jié)關(guān)鍵代謝產(chǎn)物積累的調(diào)控基因。該研究不僅對水稻基礎(chǔ)研究和育種實踐具有重要意義,還對其他作物全生育期代謝組學(xué)研究提供了借鑒。

該研究使用秈稻品種珍汕97和明恢63整個生命周期不同組織的樣品,結(jié)合靶向和非靶向代謝組學(xué)分析方法,共注釋并定量分析825種代謝物。結(jié)合代謝組和同一時期的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)構(gòu)建了水稻代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò)(RMRN)。

利用這個數(shù)據(jù)集,該研究成功使用兩種獨(dú)立的策略剖析了新的代謝途徑,分別是利用已知的轉(zhuǎn)錄因子作為誘餌來篩選木質(zhì)素代謝新的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),以及根據(jù)組織特異性無偏見地識別新的甘油磷脂代謝調(diào)控因子。因此,該研究通過多組學(xué)手段對水稻全生育期進(jìn)行了全面的代謝譜分析,其大數(shù)據(jù)資源也將促進(jìn)水稻生長調(diào)控、抗性和營養(yǎng)品質(zhì)方面的改良研究。(溫才妃 李天暢)

關(guān)鍵詞: 科研人員 水稻 全生育期代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò) 水稻全生育期

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