澳大利亞肺魚擁有已測序最大動物基因組
共含430億對堿基 超過人類基因組14倍
據(jù)英國《新科學(xué)家》雜志網(wǎng)站18日報道，奧地利分子病理學(xué)研究所的科學(xué)家發(fā)現(xiàn)，澳大利亞肺魚擁有迄今已測序所有動物最大的基因組，其基因組共包含430億對堿基，超過人類基因組14倍。
最新研究負(fù)責(zé)人齊格弗里德·斯克洛斯寧表示，此前最大已測序動物基因組來自墨西哥兩棲動物美西螈。2018年他們對其進(jìn)行了測序，但澳大利亞肺魚的基因組比其還大30%。
在最新研究中，科學(xué)家們使用高性能計(jì)算機(jī)測序儀將肺魚的基因組拼接起來。為解決測序儀可能造成的錯誤，研究人員使用了基因組的多個拷貝，每個拷貝都被分割成DNA小塊。在對所有片段進(jìn)行測序后，研究小組使用算法將片段重組成一個完整的基因組。斯克洛斯寧估計(jì)，得到結(jié)果需要計(jì)算機(jī)處理大約10萬小時。
斯克洛斯寧說，澳大利亞肺魚原產(chǎn)于昆士蘭州東南部，該動物從水基生活方式過渡到陸基生活方式以來，其外貌幾乎沒有什么變化。
此前，科學(xué)家們并不清楚肺魚和腔棘魚(一種發(fā)現(xiàn)于印度洋和印度尼西亞周圍的古老魚類)誰與哺乳動物和鳥類等陸地脊椎動物的關(guān)系更密切。新基因組分析明確指出，肺魚與四足動物的祖先關(guān)系更密切。腔棘魚較早從這些動物中分化出來;而肺魚在4.2億年前才與這些動物分道揚(yáng)鑣。
斯克洛斯寧說：“為離開水，肺魚需要適應(yīng)陸地的生活方式，必須能呼吸空氣，必須能聞到氣味。肺魚背部擁有一個肺，供其呼吸水面上的空氣。”
在與肺和關(guān)節(jié)肢體的發(fā)育以及嗅探氣味有關(guān)基因的數(shù)量方面，澳大利亞肺魚與兩棲動物相似。斯克洛斯寧說：“從基因組角度而言，澳大利亞肺魚的基因組介于魚類和陸地脊椎動物之間。”(記者劉霞)
關(guān)鍵詞： 澳大利亞肺魚
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